Non e' molto chiara la domanda.

Lo Zend Framework non e' un oggetto atomico ma sono tante classi che possono essere utilizzate singolarmente o insieme.

Quindi se tu hai voglia di utilizzare lo Zend_db puoi farlo semplicemente includendo la classe Zend_db.php e utilizzando le sue api.
Per utilizzare lo Zend framework senza stare a preoccuparsi di includere le varie cose puoi usare il suo autoloader

Quind il tuo script dovrebbe iniziare con queste istruzioni
Codice PHP:
// in genere la cartella Zend e' dentro una cartelle library
// aggiungi come path la cartella library che contiene la cartella Zend
set_include_path(get_include_path().PATH_SEPARATOR. $pathZendFramework);  
require_once('Zend/Loader.php');  
Zend_Loader::registerAutoload(); 
Con queste 3 istruzioni ti sei tolto il problema di includere le varie classi.
Potendo specificare le path non e' necessario mettere le librerie dentro httpdocs anzi in genere si mette fuori dalla cartella pubblica assieme al resto dell'applicazione.

Detto questo non ho ben capito se tu hai già in sito e devi fare il porting sotto zend framework o devi fare uno nuovo o che altro ...

Andrea