Premetto che avere due tabelle uguali non ha senso, anzi è proprio contrario alla normalizzazione di un database.
Non entro nel merito del motivo, ma è sicuramente sbagliato.

Comunque, per aggiornare basta una query di aggiornamento:

UPDATE Tabella2 SET qta = Tabella1.qta WHERE Tabella1.ID = Tabella2.ID

per ID si intende il campo chiave, che si suppone sia identico.

Ciao