Non è che hai tolto l'area di notifica? Apri le proprietà del pannello, clicca su Aggiungi ed assicurati di averla attivata. In caso affermativo, cercala e prova a ridimensionarla, nel caso l'abbia stretta per caso troppo e le icone non trovano spazio.

Daniele

PS: Per l'ambiente di sviluppo, KDevelop o Anjuta, a seconda dell'utilizzo elle Qt oppure delle gtk (o wxwindows). Sarebbe meglio però parlarne in un thread a parte.