in genere è sempre stata l'unica a non fare problemi ......... si avviava tutto con semplicita da terminale di root

prova ad esempio ad avviare konqueror da terminale di root . . .

a me comunque con su - avvia sia konqueror che nautilus

non so se dipende dal livello di sicurezza che hai selezionato durante l'installazione

io scelgo sempre normale e di default mette sicurezza piu' elevata