Codice PHP:
function selezionatutti(startName){
    var 
allInputs document.getElementsByTagName('input');
    for(
0allInputs.lengthi++)
    {
        if(
allInputs[i].type.toUpperCase() == "CHECKBOX")
        {
            var 
chkbx allInputs[i];
            if(
chkbx.name.indexOf(startName) == 0)
            {
                 
chkbx.checked true;
            }
        }
    }
}
function 
deselezionatutti(startName){
    var 
allInputs document.getElementsByTagName('input');
    for(
0allInputs.lengthi++)
    {
        if(
allInputs[i].type.toUpperCase() == "CHECKBOX")
        {
            var 
chkbx allInputs[i];
            if(
chkbx.name.indexOf(startName) == 0)
            {
                 
chkbx.checked false;
            }
        }
    }

In questo modo puoi chiamare selezionatutti('box') e tutte le checbox con il name che comincia con box vangono selezionate, stesso modo deselezionatutti('box') le deseleziona.