Devi spiegare un po' che cosa intendi tu per distanza tra pixel (immagino tra luminosità - tipo per una scala di grigi - o per componenti RGB nel caso di immagini a colori).

Comunque, si tratta di caricare l'immagine dal file e recuperarne alcuni pixel, (ti può aiutare la classe PixelGrabber).
http://java.sun.com/javase/6/docs/ap...elGrabber.html