A che mi risulta, la cartella Desktop è una cartella di sistema, e come tale risiede nella partizione dov'è installato il sistema operativo...

Voglio dire che se tu su D: installi, che so, Windows XP Home, si creerà una cartella D:\Documents and Settings\All Users\Desktop per caricare icone ed impostazioni quando sceglierai di usare XP Home...