Se vuoi sapere se se il file è vuoto, utilizza http://www.php.net/filesize:

Codice PHP:
<?php 
if (filesize('tuo_file') == 0) {
  echo(
'Il file &egrave; vuoto');
}
?>
Se vuoi sapere se il file non contiene informazioni utili (es. è formato solo da spazi/accapo, etc.) devi fare una verifica sul contenuto (es. trim(file_get_contents('tuo_file')) == ''). Anche se probabilmente ti basta solo il controllo sulla dimensione del file.