Monti la partizione vuota dove vuoi (mettiamo in /home/utente/partizione)
Entri nel SO (Linux) che vuoi copiare e da root digiti:

cp -ax / /home/utente/partizione

Copia perfettamente il SO corrente nella nuova partizione (anche a caldo).
Oppure ho utilizzato tools come G4L o Partimage.
ma quando devo replicare installazioni funzionanti uso il comando cp.