Prima di tutto voglio ringraziare sacarde perchè senza di lui non avrei mai risolto.

Per chiunque ne avesse bisogno posto come ho risolto il problema.

Ho creato lo script seguente

codice:
1 #!/bin/bash 
2 if [ ${1:0:5} = "file:" ] 
3 then nome=../../${1:6} 
4 else nome=$1 
5 fi 
6 wine path_to_Foxit.exe $nome &
poi l'ho inserito come comando da eseguire per aprire i file pdf.
In gnome:
  • tasto destro su un file pdf
  • proprietà
  • aprire la scheda apri con
  • cliccare su aggiungi
  • inserire come comando personalizzato il path assoluto dello script appena creato seguito da %u