... ok quindi diciamo che il supporto ajax non lo vuoi usare.

Per fare la cosa semplicemente a popup devi stare attento perche' la funzione che si dovra' occupare di aprire il popup dovra' anche controllare che l'utente non lo abbia gia' chiuso.

IO farei un js del genere
Codice PHP:
// var booleana per abilitare disabilitare la gestione messaggi
var loadMessages = true;
// var di contenimento riferimento al popup
var msgWin = null;
function handleMessages()
{
      if( loadMessages )
      {
            if( !msgWin )
            {
                  msgWin = window.open("url" , "parametri");
            }
            else
                  msgWin.location.reload();
            // richiama se stessa ogni 10 secondi
            window.setTimeout( "handleMessages()" , 10000 );
      }
} 
nell'html
.....
<body onload="handleMessages()">
....

Ovviamente e' un'idea potrebbe non funzionare e come tte le mattine sto a lavura' se stasera ho un attimo di tempo faccio 2-3 prove e ti mando del codice testato.
CIauz.