da quello che dici sei riuscito a far aprire le popup...
allora ti manca poco...

individua la riga seguente nel codice che ti ho postato:

eval ("page" + id + " = window.open(url,'" + id + "', ' toolbar=yes, scrollbars=yes, location=yes, statusbar=yes, menubar=yes, resizable=yes, width=800, height=600, left=50, top=50');");

è quella che setta i vari parametri...

vuoi una finestra di 100px x 100px? allora cambia width=800, height=600 in width=100, height=100...
non vuoi che la finestra sia ridimensionabile? allora cambia resizable=yes in resizable=no...
ecc.

poi se cerchi su google "popup generator" troverai di sicuro tanti siti dove la popup te la custonizzi in automatico... poi ti basta copiare il codice generato...

ciao