lol.. mi rispondo da solo.. non mi picchiate per favore.. :|
guardando il codice.. mi mancava il fatto di interrompere l'effetto precedente e iniziare quello nuovo.. in modo da non aspettare che l'effetto precendete finisse basta aggiungere Mover.cancel(); prima del nuovo effetto e il gioco è fatto 
vi posto il javascript aggiornato per maggiore chiarezza
Codice PHP:
window.addEvent('load', function() {
var HLogther = $('highligther'); // Questo è il div che faccio scorrere
var ObjContainer = $$('.menu'); // Object ul
var ListaLI = $$('.menu ul li'); // Objects li
var StartMovement = 0;
var StartSize = 0;
var Mover = new Fx.Morph(HLogther, {duration: 'short'}); // Setto l'effetto
ListaLI.each(function(el, i) { // Controllo ogni elemento (mi serve principalmente per il movimento iniziale)
if (el.hasClass('active')) { // se ha la classe active (che sarebbe magari la pagina attuale)
ListaLI.each(function(tel, j) { // sommo tutto le larghezze precedenti in modo da avere lo spostamento
if (j < i) { StartMovement += tel.getStyle('width').toInt(); }
});
StartSize = el.getStyle('width').toInt(); // prendo la larghezza attuale
}
el.addEvents({ // Aggiungo l'evento al li
'mouseenter': function() {
var movement = 0;
var size = 0;
ListaLI.each(function(tel, j) { // Stessa cosa di prima sommo le larghezze e prendo la dimensione
if (j < i) { movement += tel.getStyle('width').toInt(); }
if (j == i) { size = tel.getStyle('width').toInt(); }
});
//Mover.cacek();
Mover.cancel(); // <-- Fermo l'effetto precedente prima di applicarne uno nuovo
Mover.start({ // Applico l'effetto
'margin-left': movement,
'width': size});
}
});
ObjContainer.addEvents({ // Per evitare un minimo sovrapposizione di eventi quando esce dall'ul ripristino il div alla sua posizione iniziale
'mouseleave': function() {
Mover.cancel(); // <-- Fermo l'effetto precedente prima di applicarne uno nuovo
Mover.start({
'margin-left': StartMovement,
'width': StartSize});
}
});
});
Mover.start({ // Questo mi serve quando viene finita di caricare la pagina
'margin-left': StartMovement,
'width': StartSize});
});