mmm, si, loro lo sconsigliano perché potrebbe portare problemi, ma di norma per una minor release la compatibilità binaria non salta
non ho provato a mettere la libmysql.dll di mysql 5.1, io ho sempre usato la 5.0.
purtroppo a causa di questa genialata
http://pecl4win.php.net/
è impossibile scaricare la release nuova di php_mysql e php_mysqli nuove, ci sarebbe da compilarsele a manina scaricandosi gli include di mysql 5.1 e i sorgenti di php, copiare gli include di mysql 5.1 nella cartella di php, o specificarli tramite configurazione, e poi compilare esclusivamente la php_mysql.dll