la lentezza può essere dovuta a tanti fattori, ed è difficile che riguardi direttamente apache/mysql/php

in ogni caso per accertartene dovresti fare 3 semplici cose:
- creare una pagina statica, con estensione .html, tipo un hello world e provare ad accederci per vedere se lenta
- creare una pagina php semplice con un altrettanto semplice echo che stampi, ad esempio, un hello world
- per finire creare una pagina php che si connetta al db, lanci una sola query ed esca

nel caso che il primo vada lento il problema è dovuto o ad una mal configurazione di apache o del sistema operativo, se ti va lento nel secondo caso vuol dire che va lento con php mentre nell'ultimo caso ci colpa mysql.

In generale ti sconsiglio di usare questi pacchetti pre-pronti per sistemi di produzione e, anzi, su windows 2003 ti conviene usare più IIS che apache per far girare php

Prova eventualmente a reinstallare tutto manualmente cosi vedi se il problema dipende da qualche configurazione del pacchetto wamp