In genere mysql è più veloce di qualsiasi cosa tu possa fare in php.
In ogni caso i due cicli annidati restituiscono il risultato che dici tu: tante ripetizioni dei CF della prima tabella.
Codice PHP:
while($row = mysqli_fetch_assoc($terzi)) {
i=0;
while($row2 = mysqli_fetch_assoc($ibl)) {
if($row['cod_fiscale'] == $row2['codfisc_anaa']) i=1;
}
}
if (i==1) $ris[]=$row;
}