beh, aggiungi case allo switch copiando poi la parte che ti interessa:

Metti di voler popolare la prima e la seconda, allora aggiungi una option alla select con l'evento:
codice:
<select name="selGrande" id="selGrande">
   <option value="campo vuoto">---</option>
   <option value="sel1">Attiva la 1</option>
   <option value="sel2">Attiva la 2</option>
   <option value="sel3">Attiva la 3</option>
   <option value="sel13">Attiva la 1 e la 3</option>
</select>
Poi aggingi un case alla funzione populateSelect

Codice PHP:
 case 'sel13'
          
emptyAll();
          for(
0valuesUno.lengthi++)
          {
              var 
opt document.createElement("option");
              
opt.value valuesUno[i];
              
opt.appendChild(document.createTextNode(valuesUno[i]));
              
document.getElementById('sel1').appendChild(opt);
          }          
          for(
0valuesTre.lengthi++)
          {
              var 
opt document.createElement("option");
              
opt.value valuesTre[i];
              
opt.appendChild(document.createTextNode(valuesTre[i]));
              
document.getElementById('sel3').appendChild(opt);
          }
      break; 
E fai anche gli altri casi, in maniera simile, basta che modifichi il case, il nome degli array da cui prendi i value delle opiton e gli id nel getElementById.