Per vedere le cartelle e navigarle devi usare l'accesso ftp indipendente da joomla,tipo filezilla e altri. Oppure usare il cpanel offerto dall'hosting.
Se invece accedi a joomla dal pannello,non vedi la maggior parte delle cartelle,anzi,quasi nessuna e non vedi i vari file tipo configuration o index o robots etc etc.

Però puoi modificare il template (e anche la prima pagina,ma senza per forza metetre mano al codice ).. prova questo percorso -dopo essere entrato nel back end- "estensioni -> gestione template" e scegli il template che stai utilizzando ( marcato con una stella) e poi "modifica".
Vedrai varie opzioni tra cui i tasti (in alto a destra) di "mod-HTML" e "Mod.CSS" che ti permettono di vedere i file htmle css che regolano il template..ammesso che le varei cartelle e file di joomla siano scrivibili (trovi molti thread a riguardo sui permessi) puoi fare tutte le modifiche che vuoi. (il principale dei file css da modificare è template.css oltre mentre per l'html è index.php, che poi è quello che vedi se fai le modifiche come descritto ).

per la prima pagina,prova a vedere "contenuti -> gestione prima pagina".

Se serve altro,siamo qui.ciao ciao