Non è che si capisca molto, nel senso che così come lo poni tu, il problema semplicemente non esiste visto che già risolto. Comunque, io mettere il file (o un collegamento ad esso) nel database (cosa che personalmente farei, così ti puoi anche evitare di dover salvare ogni .doc con il nome dell'articolo a cui è collegato). Se poi ti serve poter consultare il file "online" e questo non fosse accessibile via browser, o scrivi uno script che lo vada a pescare laddove il browser non può arrivare (script del genere ne trovi già pronti, basta cercare, per esempio "force download") oppure se hai infilato tutto il file nel database in un campo blob, gli spari direttmente quello.

Altrimenti spiega meglio che devi fare.