Per registrare il desktop puoi usare Camstudio, per velocizzare il filmato ottenuto il primo software che mi viene in mente è ovviamente Premiere, di free credo anche VirtualDub solo che in questo caso non so la procedura, ma dai un'occhiata qui:
Nel menu Video frame rate control potrai impostare la velocità del video (mentre quella dell' audio rimarrà invariata). Dato che il tuo film perde gradualmente la sincronia (spero tu abbia seguito con attenzione i punti 1 e 2) dobbiamo velocizzarlo/rallentarlo in modo che combaci perfettamente con la velocità dell'audio. Se il video è in aticipo rispetto all'audio (la scena appare sullo schermo prima che tu possa sentirne il suono) devi abbassare il framerate impostandone manualmente uno minore (oppure incrementandolo se l'audio è in anticipo sul video).