ah, non ti basta JS, devi usare anche un linguaggio server per poter ottenere il contenuto della directory sul server.

Ho fatto una cosa del genere con XML (anche se ti consiglierei di usare JSON) qui

In modo da poterlo generare in automatico senza dover modificare alcun file.

Poi, puio usare una galleria tipo MooFlow, usando JSON per caricare le immagini in modo automatico: http://www.outcut.de/MooFlow/example-json.html