Devi implementare un piccolo gestore di download.
Ogni file da scaricare è un record di una tabella nel DB.
Una delle colonne è una INT e la chiami (nome super-fantasioso) CLICK.
I tuoi link per scaricare il file devono essere del tipo:
codice:
Download
La pagina download.php non fa altro che fare una query per recuperare il file associato all'ID passato via GET e aggiornare la stessa tabella con una query tipo:

Codice PHP:
$sql = "UPDATE tabella SET click = click+1 WHERE id = $id"; 
Spero di essere stato chiaro.