capisco
il file a cui tu fai riferimento non e' lo stesso a cui faccio riferimento io,
il mio l' ho preso da http://www.outcut.de/MooFlow/MooFlow.js e tra le option e' presente questo offsetY e, piu' sotto, la definizione dell' height che possono aiutarti a sistemare il problema

dove hai preso la tua versione dello script?