Sinceramente trovo molto piu' complicato usare questi tools di installazione che non installare apache, php e mysql per conto loro e gestirseli come il padre eterno vorrebbe.

phpmyadmin e' un applicativo php. Come tale ha la stessa valenza di qualsiasi altro script php, esempio: un CMS come drupal o joomla, un e-commerce o qualsiasi altra cosa scritta in php. Si prende e si scompatta nella document root e si richiama tramite un browser scrivendo l'URL appropriato.

Non ho idea di cosa fa WAMP ma mi pare che se non si puo' manco mettere la versione di phpmyadmin che piu' aggrada, sia assolutamente da buttare. Ovviamente un file di configurazione deve essere congruente con la versione in uso.