Esattamente quello che chiedi NON può essere fatto.

Quello che puoi fare è inserire un checkbox "Elimina il file" ed un campo di tipo file "Sostituisci il file".

Se l'utente seleziona il checkbox, il file viene eliminato ed i relativi campi nel DB "svuotati". Se l'utente seleziona un'altro file, esegui l'update. Altrimenti mantieni il file attuale.