Un'altro dettaglio importante è che avevo azzerato il super block del raid.
mdadm --zero-superblock /dev/md1
mdadm --zero-superblock /dev/md2
e poi ho ricreato il raid
mdadm --create /dev/md1 /dev/sdb1
mdadm --create /dev/md2 /dev/sdb2

Mi sembra di ricordare che andasse comunque in kernel panic prima di questo passaggio.
mdadm --create /dev/md1 /dev/sdb1