Puoi lasciare la /home in comune, l'importante che tutte le distro siano a 32 o 64 bit, altrimenti potrebbero darti problemi.
X la partizione di boot vai tranquillo.
La scelta della distro direi che è una cosa piuttosto relativa a cosa vuoi fare, all'hw, alle tue esigenze grafiche, di utilizzo e livello di difficolta.
Leggiti qualche recensione nel 3d in rilievo...
...Personalmente però se usi Xubuntu, con un dcore ti direi di passare a Mepis (x rimanere su Debian Based)