Per misurare le performance del codice è necessario creare dei test. Solo così puoi individuare colli di bottiglia e/o confrontare la differenza di utilizzare una query linq to xml oppure scriversi a manazza tutto il codice per tirare fuori un navigator a fronte di una query xpath.
Per realizzare questi test puoi usare lo strumento integrato dentro visual studio (vs2008->menu analyze->Performance wizard.. session ecc) oppure di terze parti come ad es. dottrace http://www.jetbrains.com/profiler/

Per quanto detto da tekanet, mi piacerebbe sapere dove e perchè si dice che linq to sql è al capolinea e che linq to entity abbia già la sua fine segnata.