non saprei se come fai tu poi si mischiano, ma per essere sicuro che siano in ordine puoi aggiungere l'indice dell'array al name dell'input

Codice PHP:
$arr = array(123);

foreach(
$arr as $indice => $valore) {
 echo 
"<input type='text' name='Nome[".$indice."]' value='".$valore."' />";