L'U3 è un sistema che permette di installare versioni appositamente sviluppate (o modificate) di alcune applicazioni direttamente sulla pendrive ed utilizzarle senza lasciare tracce sul sistema sul quale ti appoggi senza dover configurare nulla. Spesso permette anche di cifrare il contenuto della pendrive. Diciamo però che le applicazioni "portable" ed alcuni tool di cifratura offrono funzioni analoghe se non per certi versi migliori.
Maggiori informazioni le trovi su http://www.u3.com/
Se la tua pendrive supporta questa tecnologia puoi provare ad utilizzarla (funziona abbastanza bene) e vedere come ti ci trovi. Io sulla mia pendrive dopo un po' ho tolto tutto, non perchè non funzionasse, ma perchè non adopero la pendrive per avere applicazioni come skype o firefox su. Credo che come spesso accade sia questione di gusti personali.