Controlla questo link:
Using_jQuery_with_Other_Libraries

Controlla poi questo:
jQuery.noConflict

Più in generale tutte le Le librerie che derivano da Prototype (come Mootools) di fatto si appropriano della function $. Un metodo semplice per usare jQuery con le altre librerie è quello di non usare il $ ma jQuery, quindi ad esempio invece di scrivere $('#myDivId') bisogna scrivere jQuery('#myDivId').

Ciao,

Tiziano