vi ringrazio per le risposte.
Ad ogni modo si, i dati importanti sono sempre sincronizzati col mio pc fisso, questo era il portatile.
Comunque cliccando col tasto destro sulle partizioni con gparted c'è l'opzione per controllare e correggere gli errori.
Una volta fatto ciò montando la partizione avevo ancora quei file non leggibili, però una volta riavviato il sistema tutto è tornato a funzionare, i file son tutti lì e sono leggibili.
Perciò per ora sembra essere andato tutto bene ^^