Ciao
allora puoi il problema così a primo occhio sembra essere questo:

logon path = \\%L\Profiles\%U che non coincide con

[Profiles]
comment = Users profiles
path = /home/samba/profiles

come vedi gli hai impostato due path diversi,invece devo essere uguali.Dovresti modificarli così:

logon path = \\%L\Profiles\%U

e

path = /Profiles/%U

Per quanto riguarda l'aggancio della macchina al dominio io sul mio server ho messo queste semplice righe:

add user script = /usr/sbin/smbldap-useradd -m "%u"
delete user script = /usr/sbin/smbldap-userdel "%u"
add group script = /usr/sbin/smbldap-groupadd -p "%g"
delete group script = /usr/sbin/smbldap-groupdel "%g"
add user to group script = /usr/sbin/smbldap-groupmod -m "%u" "%g"
delete user from group script = /usr/sbin/smbldap-groupmod -x "%u" "%g"
set primary group script = /usr/sbin/smbldap-usrmod -g "%g" "%u"
add machine script = /usr/sbin/smbldap-useradd -w "%u"

Spero di esserti stato d'aiuto.

Saluti
Andrea