Come già detto non si formatta a basso livello frequentemente.
Il procedimento più semplice per fare quello che chiedi secondo me potrebbe essere il seguente:
1 Installare windows sull'hd (magari anche driver e programmi).
2 Creare un'immagine del disco (con il sistema installato).
3 Tornare alle origini ogni qualvolta lo reputi necessario.

Esistono numerose utility che ti permettono di farlo.
Ti posso citare PartitionMagic (anche avviabile da cd).
Altre, sinceramente, non me ne vengono in mente (sarà forse l'orario?).

PS: scusate se ho portato la discussione in ot