Secondo me hai due strade:

1) utilizzi visualstudio 2008 col framework 3.5 sp1. Questo ha integrato un framework ajax ed esiste pure il controllo timer che fa al caso tuo.

2) non utilizzi questo framework ma altro.
In questo caso puoi usare un codice simile (prendilo come speudo codice)
codice:
function controlla_database()
{
    ajax("?comando_ajax=controlla_database", onload);
    function onload()
    {
        $("div1").innerHTML = this.request.responseText;

        window.setTimeout(controlla_database,1000);
    }
}
in questo caso ti consiglio di usare jquery