Grazie vortex, intendevo proprio qualcosa di simile.
Purtroppo non sono in grado di fare da solo gli aggiustamenti (nella mia lista di cose da fare c'è "imparare bash" da circa 2 anni ma ancora non ho iniziato ).
Se hai tempo e voglia i punti sono questi:

-Penso ci sia qualche problema con i file che hanno un nome con lo spazio, tipo per "file uno.ppt" mi dà:
md5sum: file: No such file or directory
md5sum: uno: No such file or directory
etc

-Inoltre mi servirebbe confrontare anche file che si trovano in 2 cartelle differenti.