Ma che editor usi?
Se, ad esempio, avessi usato, per provare lo script, il caro vecchio buon Firefox con il plugin FireBug, ti saresti accorto subito che il tuo sorgente ha errori di sintassi.
Dove?
In alcuni caratteri che sono illegali: gli apici che hai messo!
Questo funziona o, perlomeno, il div si muove!
(sta poi a te farlo muovere dove vuoi!)
in rosso i caratteri sostituiti.
codice:
    <script type="text/javascript">
		var div = null;
		var msec = 220;
		var id = 0;
		
		function init() {
            div = document.getElementById("riquadro3"); //DIV da animare
            div.style.top = "130px"; //Punto di partenza dell’animazione
            animate(); //Chiamata alla funzione che anima il div
        }

        function animate() {
            div.style.top = parseInt(div.style.top)+1+"px";//Sposta il div verso l'alto di un pixel alla volta
            id = setTimeout(animate,msec);//Ripete lo spostamento per tot millisecondi
        }

        window.onload = init; //fa iniziare l'animazione al caricamento della pagina
		
    </script>
HTH
Zappa