non sei molto chiaro. Se vedi solo le tabelle .frm potrebbe trattarsi di tabelle InnoDB. Se invece fossero tabelle MyISAM e la versione di mysql la stessa (portatile e server) potresti "tentare" la copia becera di tutta la cartella data (dopo aver fermato il server mysql).

Se hai tabelle InnoDB non c'e' santo ... ci vuole backup/restore.

Prova anche a fare il tutto con mysql administrator.