estrai con la select "data_out - data_in" AS pippo

poi prendi "pippo" e lo passi a strtotime()...

quindi facciamo finta che tu hai portato $row["pippo"] in $differenza

Codice PHP:
$differenza $row['pippo']; 

if(
$differenza >= 3600)
     {
      
$ciccio $differenza 3600;
      
$differenza strftime("%H:%M:%S"$ciccio);
      } else {
                
$differenza "00:".strftime("%M:%S"$differenza);
                }

echo 
$differenza