Devi spiegare meglio che cosa intendi per "sotto"!

Io comunque farei in modo che la funzione chiamata su onclick facesse insieme un fadeout degli altri riquadri e un fadein del riquadro cliccato, le funzioni di jquery che una volta selezionati tutti i quadrati, ti permettono di rimuovere solo l'elemento cliccato mi sembrano ottimali!