Se ne e` parlato molte volte, per cui se vuoi approfondire dovresti farlo tramite ricerca nel forum.

Con solo HTML e CSS non e` possibile.

Possibilta` UNO:
modifichi il codice incluso, in modo da inserire una classe nel link relativo alla pagina; non so quale linguaggio usi per l'include: se usi un linguaggio con possibilta` di programmazione (PHP, ASP, JSP, ..) la cosa e` possibile e semplice; se usi SSI non credo sia possibile

Possibilita` DUE:
aggiungi la classe specifica dopo il caricamento della pagina tramite JS, che in questo caso risulta non-intrusivo, dato che si tratta solo di una modifica cosmetica.