Tramite batch non saprei. Con la powershell, che hai già usato in precedenti thread, te la cavi con una riga. Lo script te li restituisce anche in ordine decrescente di numero di file per estensione.

codice:
gci "c:\tuo_path\tua_cartella\" -rec | ? {-not $_.psiscontainer} | group-Object -property extension | Sort-Object -property count -desc | Select-Object @{name="Estensione";Expression={$_.name.substring(1)} },count