secondo me hai due possibilità:

1) ti crei degli array nel codice javascript contenti le immagini e al click sul link fai partire lo slideshow che ti devi necessariamente adattare alla bisogna magari partendo da uno degli script trovati in rete.

2) altra soluzione, soprattutto se vuoi che lo script prenda in automatica le immagini contenute nelle varie cartelle, è ricorrere ad ajax e a uno script lato server. anche in questo caso suppongo che tu ti debba ingegnare un po' nell'integrare il tutto con un slideshow, perchè temo che qualcosa di bellepronto esattamente come vuoi tu non c'è.