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Basta che sull'onclick del pulsante tu lo disabiliti, per poi riabilitarlo quando hai ricevuto i dati..
Così il secondo click in sequenza non esegue nulla perchè il pulsante è disabilitato:

onclick="document.getElementById('idDelPulsante').disabled=true;tuaFunzioneCheLeggeIDati();"

nella tua funzione che prende i dati, quando sei sicuro di averli presi tutti (oppure se e quando è andata in errore), esegui:

document.getElementById('idDelPulsante').disabled=false;

HTH
Zappa