Da quello che so gli SWF caricati su livelli sono difficili da gestire in quanto non hanno un percorso. Quello che ti consiglio è di creare un MC nella posizione che vuoi e caricarci man mano le varie sezioni sopra con loadMovie(nome_swf, target_MC)
Fra l'altro ti consiglio di scaricare gli SWF ogni volta che ne carichi uno nuovo, con unloadMovie(target_MC)
ciao