L'ideale sarebbe mettere la redirect nel file htaccess della tua root con dentro una espressione regolare che ti consenta di lasciare fuori dal redirect una specifica cartella, consentendo invece il redirect di tutto il resto.
per questo ci sto guardando.
in alternativa, dal momento che le cartelle figlie di una cartella con dentro l'htaccess ne ereditano le caratteristiche, potresti mettere li il redirect !
ciao