Da quel pò che ho capito, potresti passare l'url della cartella in una flashvar sull'html o sul php.
Es. senza script:
codice:
<embed src="fileflash.swf" width="larghezza" height="altezza" flashvars="percorso=cartella/pagina.html"></embed>
e nel flash utilizzerai la variabile "percorso" per aprire quest'ultimo:
paginaDaAprire=percorso;