Onestamente non ricordo se al momento dell'iscrizione avessi indicato un solo sito per poi aggiungerne altri o altro ma nella configurazione dell'account puoi decidere se gli ad siano validi su qualsiasi sito o se definire manualmente i siti su cui gli ad possono essere considerati validi e ne puoi inserire parecchi (non ricordo se ci sia un limite).

Riguardo al discorso della partita IVA è una questione sulla quale si è dibattuto tantissimo e anche su questo forum puoi trovare vari messaggi.

Su Altervista vige un contratto tra te e loro: verifica intanto se puoi mettere AdSense o solo la pubblicità gestita da loro e nel caso tu possa mettere AdSense se ci sia una divisione degli introiti.