Un'ottima soluzione potrebbe essere questa (free)

http://allwaysync.com/it/index.html

Fai però molta attenzione ad una cosa: "backup" e "sincronizzazione cartelle" sono due concetti completamente diversi

Se nel tuo server A per errore cancelli un file, la "sincronizzazione" lo cancellerà anche dal server B... (e non potrai quindi usarlo come recovery). il "backup" invece lo manterrà, proprio per poterlo poi ripristinare...

E' quindi necessario capire bene cosa si vuole fare e quali siano di conseguenza le situazioni in cui è meglio importare regole di "sincronizzazione" o regole di "backup" (ad uso disaster recovery)