Ricordo da reminescenze passate che per avere un dual-boot con windows 98 e XP, bisognava installare PRIMA windows 98 e poi XP.
Io procederei cosi allo stato attuale. Staccherei fisicamente l'HD dove sta XP.
Installerei quindi Windows 98 sull'unico HD connesso, ovviamente fat32 come suggeriva gas75.
Poi riattaccherei l'hardisk di XP e switccerei tra uno e l'altro hardisk per la partenza tramite bios (hd0 oppure hd1 come first boot).

Se invece vuoi il dual boot formatta tutto e installa prima win98 su hd1 e poi xp, che ti creerà il dual boot, su hd2.